Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms