Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP6Q96RT7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP6Q96RT7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms