Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC38A2Q96QD8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms