Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms