Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms