Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6S4

ANKRD13C, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13CQ8N6S4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD13CQ8N6S4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms