Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC158Q5M9N0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms