Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC178Q5BJE1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC178Q5BJE1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms