Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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