Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UPP1Q16831 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms