Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms