Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CA9Q16790 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CA9Q16790 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CA9Q16790 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CA9Q16790 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CA9Q16790 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms