Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYPL1Q16563 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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