Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms