Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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