Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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DNASE1L3Q13609 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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