Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2AQ12879 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2AQ12879 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms