Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLFN5Q08AF3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLFN5Q08AF3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms