Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms