Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms