Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms