Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms