Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HBBP68871 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HBBP68871 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms