Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP1B3P54709 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms