Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNT2P45379 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNT2P45379 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms