Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1BP36896 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms