Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAP3P28838 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAP3P28838 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAP3P28838 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAP3P28838 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAP3P28838 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAP3P28838 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAP3P28838 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAP3P28838 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAP3P28838 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAP3P28838 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAP3P28838 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAP3P28838 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAP3P28838 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAP3P28838 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAP3P28838 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms