Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCEA1P23193 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms