Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CXCL3P19876 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CXCL3P19876 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CXCL3P19876 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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