Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPB42P16452 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPB42P16452 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPB42P16452 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPB42P16452 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPB42P16452 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms