Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms