Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM2O94769 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM2O94769 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM2O94769 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM2O94769 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM2O94769 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM2O94769 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM2O94769 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ECM2O94769 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ECM2O94769 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ECM2O94769 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM2O94769 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM2O94769 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM2O94769 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms