Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEBLO76041 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms