Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLIN3O60664 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLIN3O60664 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms