Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHOX2AO14813 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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