Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms