Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC4A6NH21 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms