Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNOT6Q9ULM6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms