Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms