Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms