Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COMMD8Q9NX08 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COMMD8Q9NX08 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms