Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF17Q9BXT8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms