Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TINF2Q9BSI4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TINF2Q9BSI4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms