Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIN3AQ96ST3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms