Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPS6KC1Q96S38 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms