Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms