Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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TRIM63Q969Q1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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