Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC103Q8IW40 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms