Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM46CQ5VWP2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms