Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms